As samambaias produzem uma toxina em suas folhas que desencoraja a maioria dos vertebrados de comê-las, embora os dinossauros comessem essas plantas em grandes quantidades antes de sua extinção. A maioria dos insetos e animais que comem samambaias comem apenas espécies específicas de samambaia durante épocas específicas.
Vários animais e muitos insetos comem samambaias.Mamíferos
O woodmouse europeu, ou Apodemus sylvaticus, come apenas os esporos férteis da samambaia europeia Culcita macrocarpa, e apenas entre dezembro e janeiro. O morcego de cauda curta, Mystacina tuberculata, também come esporos de samambaia. Os cervos e o coelho de coelho oriental geralmente comem samambaias jovens.
Pássaros
Durante o inverno e o início da primavera, o Dom-fafe dos Açores, ou Pyrrhula murina, come os esporos com alto teor de gordura de três espécies específicas de samambaia. Na primavera e no início do verão, os bullfinches mudam para três tipos diferentes de samambaia. Durante a primavera, os pássaros às vezes comem as folhas das samambaias também.
Insetos
O vespão e várias espécies de lagarta comem a samambaia de samambaia. O inseto de samambaia peruano come exclusivamente samambaias. Outros insetos que comem samambaias incluem pulgões, moscas-brancas, vermes, besouros, grilos e gafanhotos.